Me parece muy raro que haya llegado el agua a la admision, ya que lo normal es que se quede en el intercooler de abajo. De todas formas si te tira agua por el escape significa que el agua está entrando en la caracola de escape, no en la de admision, que son independientes. En el caso de que te haya entrado agua en la caracola de admision, el intercooler se llena de agua y no deja paso al aire, por lo que el coche se ahoga y se para.

Puedes reparar el turbo, pero la opcion más economica es que te compres uno chino en ebay, yo tengo en la kangoo uno chino y ha durado mas que el de serie,